分水滤气器的效率随设计(空气流动路径的排列)的分水杯的功能（自动排水，手动排水，手自动排水）不同而不同。

进入分水滤气器的压缩空气必须流过涡旋叶((1)，使其产生旋转作用。旋转的离心作用将水滴与固体物质投向分水滤气器杯(2)的内壁，然后集聚在杯底。压缩空气则通过分水滤气器杯(3)至出口出去。压缩空气中仍能带走的灰尘颗粒大小视分水滤气器杯的网孔宽度而定。标准分水滤气器使用的网孔宽度为30至70um。

超微型分水滤气器则可有3um的网孔宽度。

分水滤气器杯必须时常清理黏附在网子中的灰尘与锈粒，不然将降低分水滤气器的能力。清理分水滤气器杯的时间间隔，因受使用时数与空气中污染物含量以及空气留置时间的影响，无法作统一的规定。

分水滤气器使用注意事项:

当凝结水到达最高液面时，必须将它放出。此可以顺时针方向旋转螺塞(4)来完成。